7
миллиграммах.
- Лизис клеток, сорбцию и очистку ДНК проводят по ГОСТ Р 52723 в пробирках с подготовленной по 6.3.5 пробой.
- Приготовленный по 6.4.2 очищенный экстракт ДНК переносят в чистую микропробирку, не задевая при этом осадка, поскольку попадание в нее сорбента может в дальнейшем приводить к ингибированию ПЦР. Полученный экстракт ДНК используют для проведения амплификации и при необходимости хранят при температуре 4 °С не более 1 мес или при температуре минус 18 °С не более одного года.
- В чистую микропробирку отбирают 0,03—0,08 см3 ТЕ-буфера (элюирующего раствора) по ГОСТ Р 52723 и используют при проведении амплификации в качестве контрольной отрицательной пробы (проба К-).
- Проведение анализа
Для выявления фрагментов видоспецифичной ДНК растений и животных используют наборы реагентов для амплификации методом ПЦР, содержащие праймеры 4, специфичные к ДНК определенного вида птиц.
- Амплификация фрагментов видоспецифичной ДНК птиц с детекцией продуктов амплификации методом электрофореза
- В штативе размещают и маркируют необходимое число микропробирок с лиофильно высушенной амплификационной ПЦР-смесью по ГОСТ Р 52723 (три пробирки для каждой пробы), включая пробирки для положительного и отрицательного контролей.
- В каждую микропробирку с ПЦР-смесью при помощи автоматического дозатора по ГОСТ Р 52723 последовательно вносят 10 мм3 ПЦР-растворителя по ГОСТ Р 52723 и 5 мм3 смеси праймеров 4для выявления фрагмента видоспецифичнойДНКптиц. Перед использованием смесь праймеров необходимо разморозить в твердотельном термостате по ГОСТ Р 52723 при температуре 4 °С, перемешать на микроцентрифуге-встряхивателе в течение 5—10 с, а затем собрать осаждением на дно микропробирки путем центрифугирования на микроцентрифуге-встряхивателе по ГОСТ Р 52723 при 2000 об/мин в течение 3—5 с. Последующую работу с праймерами рекомендуется проводить при температуре от 2 °С до 4 °С с использованием твердотельного термостата с охлаждением по ГОСТ Р 52723.
- В микропробирку с ПЦР-смесью для отрицательного контрольного образца вносят 5 мм3 ТЕ-буфера (отрицательная контрольная проба К-), подготовленного по 6.1. Затем в микропробирки с ПЦР-смесью добавляют по 5 мм3 экстракта ДНК (6.4.2) (три пробирки для каждого изисследуемыхобраз- цов). В последнюю очередь в микропробирку с ПЦР-смесью для положительного контрольного образца вносят 0,005 см3 положительной контрольной пробы (К+).
- Содержимое микропробирок растворяют путем легкого перемешивания на микроцентрифуге-встряхивателе. После этого собирают осаждением капли ПЦР-смеси со стенок микропробирок путем центрифугирования на микроцентрифуге-встряхивателе по ГОСТ Р 52723 при 2000 об/мин в течение 3—5 с.
- Если для проведения амплификации используется амплификатор без нагреваемой крышки, то в каждую микропробирку добавляют по 0,020—0,025 см3 (две капли) вазелинового масла.
Плотно закрытые микропробирки центрифугируют в течение 5—7 с на микроцентрифуге-встряхивателе при 2000 об/мин и помещают в амплификатор по ГОСТ Р 52723 для проведения амплификации по программе, указанной в таблице 1. По окончании действия программы пробирки извлекают из амплификатора и в штативе передают на этап детекции продуктов ПЦР методом электрофореза.